承担食品安全综合协调、组织查处食品安全重大事故的责任，组织制定地方性食品安全标准，负责食品及相关产品的安全风险评估、预警工作，统一发布云南重大食品安全信息。牵头建立食品安全综合协调机制，负责食品安全综合监督。
拟订云南重点医学科技规划，参与制定云南医学教育发展规划，组织开展云南医学继续教育工作；组织实施云南重点医药卫生科研攻关项目，指导医学科技成果的普及应用工作。
拟订云南区域卫生规划，统筹规划协调云南卫生资源配置。
指导云南卫生人才队伍建设工作，组织拟订云南卫生人才发展规划，组织实施卫生专业技术资格标准。
