负责山西卫生应急工作，制定卫生应急预案和政策措施，负责突发公共卫生事件监测预警和风险评估，指导实施突发公共卫生事件预防控制与应急处置，发布突发公共卫生事件应急处置信息。
拟订山西重点医学科技规划，参与制定山西医学教育发展规划，组织开展山西医学继续教育工作；组织实施山西重点医药卫生科研攻关项目，指导医学科技成果的普及应用工作。
贯彻预防为主方针，开展全民健康教育；制定山西疾病防治规划和措施，并组织实施；负责传染病、地方病和其他常见病、多发病的防治工作。
指导规范卫生行政执法工作，按照职责分工负责山西职业卫生、放射卫生、环境卫生和学校卫生工作，负责公共场所和饮用水的卫生安全监督管理，负责传染病防治监督。
