重庆疾病预防控制中心

建设重庆市级疾病控制网络信息平台，管理重庆疫情及相关公共卫生信息网络。
承担上级交办的其他工作。
承担重庆病原微生物、毒物、污染物等检验及相关鉴定工作；承担重庆辖区内疾病预防控制机构实验室质量控制工作。
承担重庆县（市）疾病预防控制机构业务指导和考核、人员培训工作。开展疾病预防控制应用性科学研究，推广先进技术。

下属机构

性病艾滋病防治科 负责对重庆艾滋病病人和感染者的随访、检测、治疗工作。
负责重庆辖区内人员的自愿咨询检测工作。
负责对重庆高危场所的高危人群的干预工作。
负责重庆性病、艾滋病的疫情分析及预测预报，疫情管理。
地方病防制与消杀科 负责重庆消毒药械、杀虫药械的功能功效检测检验工作。
负责重庆消毒杀虫工作的监测、培训、考核和技术指导工作。
开展对重庆地方病和寄生虫病的诊疗服务。研究消杀工作常规、措施和技术标准。
开展重庆预防控制和监测工作，负责碘缺乏病的监测，开展碘缺乏病预防控制工作。
免疫规划科 组织开展重庆社会性、群众性健康教育工作，围绕卫生工作与疾病预防控制工作的中心任务，有计划开展经常性健康教育活动及城乡、学校、医院等健康教育与健康促进工作。
负责重庆冷链管理，计免资料管理和预防用生物制品的供应、贮存和管理工作。
负责组织实施重庆预防接种及其管理，预防接种异常反应应诊断与处理、业务指导，开展病原学、血清学、免疫学监测工作，开展免疫针对传染病的预防控制和疫情监测。
实施重庆免疫规划相关传染病的预防控制与相关管理措施的落实。

重庆地区行政机构

中医管理局中国致公党重庆委员会中心血站中招办九三学社乡镇企业局事业单位登记管理局二轻工业局交通局（公安交通管理局）人事局人劳局人口与计生委人才市场人民代表大会常务委员会人民对外友好协会人民政府办公室人民政府参事室人民政府法制办公室人民政府研究室人民检察院人民法院人民防空办公室住房公积金管理中心体委体育局供电公司供销社（供销联社）信息产业局信访局党史研究室

其他地方疾病预防控制中心