深圳市水产局

进行调查研究，综合分析工作情况，提出指导工作的意见和建议。
负责深圳市水产局行政事务、车辆管理使用。
按照深圳市水产局领导和上级要求起草文件、报告请示、总结、工作汇报、信息等多种文稿，办理上呈下达的文电、负责文书处理。
负责深圳市水产局档案资料的收集、整理、立卷。

下属机构

渔政处 承担深圳市渔业行政案件复议诉讼和相关法律咨询工作。
组织、指导和监督深圳市自然保护区和水产种质资源保护区建设与管理工作。
组织、协调、指导深圳市涉水工程对渔业资源影响的环境评价和资源补偿工作。
拟定深圳市渔业资源与生态环境管理、保护和开发规划，并负责组织实施。
船检港监管理处 负责制定深圳市地方性规章制度和管理办法，依法进行渔业船舶登记、渔业水域防污管理和渔港内的安全及港务管理工作，组织检查渔船安全状况并处理渔业水域交通事故。
负责组织开展深圳市渔业互助保险、渔业机动渔船燃油补贴管理、渔港规划建设和经营管理，渔业捕捞许可工作。
负责组织深圳市渔船船员培训及考试发证工作，办理船舶进出渔港签证及渔业航标管理工作。
负责深圳市渔船及其船用产品节能减排工作指导和监管工作。
质安办 负责深圳市渔业苗种、饲料、鱼药、渔机具等生产资料和加工品的质量安全管理、认证和使用。参与渔资打假工作。
负责组织深圳市水产品质量安全检查工作。
负责协调深圳市渔业“三站合一”（水产品质量检测、渔业环境监测、水生动物病害防治）综合职能工作。
负责深圳市水产品产地准出、市场准入及质量追溯工作。

深圳市地区行政机构

中医管理局中国致公党深圳市委员会中心血站中招办九三学社乡镇企业局事业单位登记管理局二轻工业局交通局（公安交通管理局）人事局人劳局人口与计生委人才市场人民代表大会常务委员会人民对外友好协会人民政府办公室人民政府参事室人民政府法制办公室人民政府研究室人民检察院人民法院人民防空办公室住房公积金管理中心体委体育局供电公司供销社（供销联社）信息产业局信访局党史研究室

其他地方水产局