新疆文物局

负责新疆文物科技保护和科研工作的指导和规划。
依法对新疆可移动文物进行监督管理。
检查、指导、协调新疆文物安全保卫和消防、技防工作，督查新疆文物行政执法工作;对查处盗窃、破坏、走私文物的大案要案提出专业性意见。
负责新疆博物馆的监督与管理。促进博物馆职能作用的发挥。

下属机构

文物管理处 负责组织、指导新疆省级以上文物保护单位的“四有”工作，建立省级以上文物保护单位的“四有”记录档案。
管理新疆文物考古的调查、勘探和发掘，负责考古发掘领队资格的审核、申报和文物勘探单位资格的审定、考核，审核、审批涉及文物保护的基本建设项目，组织新疆考古勘探工作的实施与管理。
负责组织对新疆文物建筑设计、施工单位和项目经理的资质评审工作。
编制新疆文物建筑保护维修规划，制定年度保护维修项目计划，组织审批维修工程方案，审核、审批县级以上文物保护单位的保护维修项目，组织重点文物保护工程方案的设计、论证、施工、监督和验收。
博物馆管理处 负责组织新疆文物学术研究和科技成果的鉴定、评奖、宣传和推广工作。
组织和管理新疆的文物外展工作，负责申报并办理有关手续。
审批、申报馆际间藏品交换、调拨互展和借展工作。
会同有关部门做好新疆博物馆、纪念馆收藏文物的分级鉴定和藏品的科学保管工作。
办公室 负责新疆文物局机关政务运行协调工作，组织制定并督查局机关各项规章制度的落实。
负责管理新疆文物局机关行政经费的开支，负责机关财产、设备的购置，固定资产的管理，局机关车辆管理以及驾驶员的交通安全教育。
负责新疆文物局信访接待协调工作。
负责新疆文物局机关及局系统社会治安综合治理的协调工作。

新疆地区行政机构

专用通信局中国致公党新疆委员会乡企局交通运输厅（交通厅）人事厅人力资源和社会保障厅人口和计划生育委员会人防办住房和城乡建设厅体育局供销社保密委员会办公室保监会信访局党史研究室党校公安厅共青团农业厅农牧厅农科院出版局劳动和社会保障厅卫生厅参事室发改委台办司法厅商务厅国土资源厅

其他地方文物局