呼和浩特卫生局

负责制定呼和浩特传染病和慢性非传染性疾病的防治规划。依法监测传染病，建立预警机制，防止和控制疫情的暴发和蔓延；组织开展全民健康教育与促进。
负责制定呼和浩特当地中医药工作发展规划，促进中医药事业和中西医结合工作的协调发展。
负责呼和浩特有关行政复议受理和行政诉讼应诉工作。
根据呼和浩特当地国民经济和社会发展总体规划，编制呼和浩特当地卫生事业的发展规划、区域卫生规划和年度工作计划，并负责组织实施。

下属机构

法制监督处 承担呼和浩特卫生局行政复议和应诉的有关工作。
起草卫生方面的呼和浩特地方性法规草案、政府规章草案。
负责呼和浩特卫生局推进依法行政综合工作。
组织开展整顿和规范呼和浩特医疗服务市场工作，组织打击非法行医，督查督办重大违法案件。
卫生应急办公室 建立、完善呼和浩特卫生应急信息系统。
指导呼和浩特突发公共卫生事件的预防准备、监测预警、处置救援、风险分析评估等卫生应急工作。
拟订呼和浩特突发公共卫生事件应急预案及相关专项应急预案，组织指导有关应急预案的日常演练和相关知识、技能的培训工作。
承担呼和浩特突发公共卫生事件应急指挥部办公室工作。
医政处 负责呼和浩特执行医疗技术应用准入制度和从业人员资格认定及注册工作。
负责呼和浩特医疗机构(含血站、急救站)的资格审批。
监督管理呼和浩特公立医院，推进公立医院管理体制改革工作。
拟订呼和浩特医疗机构设置规划。

呼和浩特地区行政机构

中医管理局中国致公党呼和浩特委员会中心血站中招办九三学社乡镇企业局事业单位登记管理局二轻工业局交通局（公安交通管理局）人事局人劳局人口与计生委人才市场人民代表大会常务委员会人民对外友好协会人民政府办公室人民政府参事室人民政府法制办公室人民政府研究室人民检察院人民法院人民防空办公室住房公积金管理中心体委体育局供电公司供销社（供销联社）信息产业局信访局党史研究室

其他地方卫生局