崇明县出入境检验检疫局

负责实施崇明县出入境交通运载工具和集装箱及容器的卫生监督、检疫监督和有关的适载检验、鉴定，负责出入境交通运载工具、集装箱、包装物及铺垫材料和货物的卫生除害处理的管理工作。
承办国家出入境检验检疫局交办的其他工作。
负责实施国家实行进口许可制度的民用商品的入境验证，负责崇明县出口、转口商品的有关出境验证。
负责人事管理、教育培训、外事、财务、基建、物资管理、纪检监察、精神文明建设与思想政治工作。

下属机构

通关业务处 承担报检单位及报检员的监督管理工作。
组织提出崇明县口岸设施的规划布局方案。
负责崇明县电子报检数据的审核、检验检疫业务布控工作。
负责崇明县出入境证单、签证业务印章、封识标志、原产地证和计费的管理工作。
稽查处 承担崇明县授权的行政处罚案件的调查与执行、检验检疫违法案件举报与业务投诉的处理等工作。
负责崇明县行政执法监督检查、工作质量检查、专项执法稽查、外埠通关抵京法检货物稽查等工作。
负责崇明县质量管理体系运行、绩效管理工作。
制定崇明县行政执法稽查工作规章制度和综合行政管理体系文件并组织实施。
法制处 组织起草崇明县全局性工作报告。
组织开展崇明县年鉴与地方志编写、检验检疫业务调研等工作。
负责崇明县技术性贸易措施相关工作。
负责崇明县行政处罚、行政诉讼、行政复议、司法调查、行政审批等管理工作。

崇明县地区行政机构

中医管理局中国致公党崇明县委员会中心血站中招办九三学社乡镇企业局事业单位登记管理局二轻工业局交通局（公安交通管理局）人事局人劳局人口与计生委人才市场人民代表大会常务委员会人民对外友好协会人民政府办公室人民政府参事室人民政府法制办公室人民政府研究室人民检察院人民法院人民防空办公室住房公积金管理中心体委体育局供电公司供销社（供销联社）信息产业局信访局党史研究室

其他地方出入境检验检疫局