昌吉州人民检察院

对昌吉州地方各级人民检察院和监所派出检察院依法对执行机关执行刑罚的活动和监管活动是否合法实行监督。
协同昌吉州主管部门管理人民检察院的机构设置和人员编制。
对昌吉州各级人民法院已经发生法律效力、确有错误的判决和裁定，依法向最高人民法院提起抗诉。
组织指导昌吉州检察系统干部教育培训工作，规划和指导检察系统的培训基地及师资队伍建设等工作。

下属机构

反渎职侵权局 研究、制定昌吉州反渎职侵权工作计划和制度规范。
负责对昌吉州检察机关办理国家机关工作人员渎职犯罪和国家机关工作人员利用职权实施的非法拘禁、刑讯逼供、报复陷害、非法搜查等侵犯公民人身权利的犯罪以及侵犯公民民主权利的犯罪案件的侦查工作的指导。
转办、督办和参与办理最高人民检察院等上级单位交办的昌吉州渎职侵权犯罪案件以及重大渎职侵权犯罪案件。
直接立案侦查昌吉州性重大渎职侵权犯罪案件。
反贪污贿赂局 研究、制定昌吉州检察机关反贪污贿赂工作计划以及执行有关法律、法规的工作细则、规定。
反贪污贿赂局内设办公室、指导处、侦查处、职务犯罪大案要案侦查指挥中心办公室。
负责对昌吉州检察机关办理贪污、贿赂等职务犯罪案件侦查工作的指导。
对昌吉州贪污、贿赂等职务犯罪大案要案进行督办。
未成年人案件检察处 负责办理涉及未成年人的案件。审查批准昌吉州分院批捕的侦查机关提起延长羁押期限的案件。
对昌吉州分院不批准逮捕、不起诉的案件备案审查。
审查昌吉州公安机关对分院不批准逮捕、不起诉的案件的复核。办理二审上诉、抗诉案件。
对昌吉州重大、复杂、疑难、敏感的案件进行个案指导。

昌吉州地区行政机构

中医管理局中国致公党昌吉州委员会中心血站中招办九三学社乡镇企业局事业单位登记管理局二轻工业局交通局（公安交通管理局）人事局人劳局人口与计生委人才市场人民代表大会常务委员会人民对外友好协会人民政府办公室人民政府参事室人民政府法制办公室人民政府研究室人民检察院人民法院人民防空办公室住房公积金管理中心体委体育局供电公司供销社（供销联社）信息产业局信访局党史研究室

其他地方人民检察院