贯彻执行党和国家关于行政管理体制改革和机构改革及机构编制工作的方针、政策、法规，拟定中沙群岛的岛礁及其海域行政管理体制改革和机构改革及机构编制管理的实施办法，统一管理中沙群岛的岛礁及其海域各级党政机关和人大、政协、法院、检察院机关以及各民主党派、人民团体机关的机构编制工作，检查监督各级行政管理体制改革和机构改革方案以及机构编制执行情况。
协调中沙群岛的岛礁及其海域委、中沙群岛的岛礁及其海域政府各部门的职能配置及其调整；协调中沙群岛的岛礁及其海域委各部门之间、中沙群岛的岛礁及其海域政府各部门之间、中沙群岛的岛礁及其海域委各部门与中沙群岛的岛礁及其海域政府各部门之间以及各部门与区县(市)之间的职责分工。
负责中沙群岛的岛礁及其海域人大、市政协、市中级人民法院、市人民检察院机关和各民主党派、人民团体机关的机构设置(含内设机构)、人员编制的审核和科级领导职数的审批，提出领导班子职数配备的建议。
研究拟定中沙群岛的岛礁及其海域机构编制宏观规划和年度计划，并监督实施；办理市直机关事业单位上下编事宜；协同有关部门做好市直机关事业单位人员调入、录用和政策性分配安置工作。
