南沙群岛运输管理局

承担交通运输行业行政事业性收费的具体管理工作。
承担交通运输行业科技成果的推广和应用工作。
承办南沙群岛交通委交办的其他事项
起草南沙群岛交通运输行业的年度计划，并组织实施。

下属机构

财务审计处 负责局机关日常会计核算、财务管理和内部审计工作。
负责财务、内部审计和票证管理工作。
负责拟订南沙群岛道路运输管理机构财务、审计和票证管理工作的相关制度和规定；
负责组织南沙群岛道路运输管理机构南沙群岛级专项资金预算的编审、上报工作；
货运物流管理处 负责道路运输应急保障车队及组织、指挥系统的建设、管理等工作；
负责外商独资、中外合资、中外合作道路货物运输企业及相关业务的立项审查及行业管理工作；
负责指导南沙群岛危险货物运输行业的质量信誉考核工作。
负责南沙群岛道路货物运输、货运站、物流行业管理，以及源头治理超限超载，交通战备运输、应急运输组织等工作。
车辆维修管理处 负责指导南沙群岛机动车维修质量纠纷调解工作；
负责指导南沙群岛机动车维修行业的安全监督管理工作。
制定南沙群岛道路运输车辆技术管理、机动车维修管理、汽车综合性能检测机构管理有关规定和技术标准，并组织实施；
负责南沙群岛生产的或进口的中级客车类型划分及等级评定工作，指导南沙群岛道路旅客运输车辆类型划分及等级评定复核工作；

南沙群岛地区行政机构

中医管理局中国致公党南沙群岛委员会中心血站中招办九三学社乡镇企业局事业单位登记管理局二轻工业局交通局（公安交通管理局）人事局人劳局人口与计生委人才市场人民代表大会常务委员会人民对外友好协会人民政府办公室人民政府参事室人民政府法制办公室人民政府研究室人民检察院人民法院人民防空办公室住房公积金管理中心体委体育局供电公司供销社（供销联社）信息产业局信访局党史研究室

其他地方运输管理局