贯彻执行党和国家关于卫生和计划生育及中医药工作的法律、法规和方针、政策；落实卫生和计划生育各项标准和技术规范；编制卓尼县卫生和计划生育区域发展规划并组织实施；负责协调推进卓尼县医药卫生体制改革和医疗保障，统筹规划卓尼县卫生和计划生育服务资源配置。
负责制定卓尼县医疗机构和医疗服务全行业管理办法并监督实施；负责监督实施医疗机构及其医疗服务、医疗技术、医疗质量、医疗安全以及采供血机构管理的规范、标准；会同有关部门贯彻执行国家卫生专业技术人员准入、资格标准；贯彻实施卫生专业技术人员执业规则和服务规范，建立医疗服务评价和监督管理体系。
组织建立完善卓尼县计划生育利益导向、计划生育特殊困难家庭扶助和促进计划生育家庭发展等机制；负责协调推进有关部门、群众团体履行计划生育工作相关职责，建立与经济社会发展政策的衔接机制，落实稳定低生育水平政策措施。
负责制定卓尼县疾病预防控制规划、免疫规划、严重危害人民群众健康的公共卫生问题的干预措施并组织落实；根据国家检疫传染病和监测传染病目录，制定卓尼县卫生应急和紧急医学救援预案、突发公共卫生事件监测和风险评估计划；组织和指导卓尼县突发公共卫生事件预防控制和各类突发公共事件的医疗卫生救援，收集上报突发公共事件的相关信息，根据授权发布法定报告传染病疫情信息、突发公共卫生事件应急处置信息。
