负责组织拟订并实施阿荣旗基层卫生和计划生育、妇幼卫生发展规划和工作措施，负责阿荣旗基层卫生和计划生育、妇幼卫生服务体系建设，推进基本公共卫生和计划生育服务均等化，完善基层运行新机制和乡村医生管理制度。
负责制定阿荣旗医疗机构和医疗服务全行业管理办法并监督实施；负责监督实施医疗机构及其医疗服务、医疗技术、医疗质量、医疗安全以及采供血机构管理的规范、标准；会同有关部门贯彻执行国家卫生专业技术人员准入、资格标准；贯彻实施卫生专业技术人员执业规则和服务规范，建立医疗服务评价和监督管理体系。
负责组织实施阿荣旗公立医院改革，建立公益性为导向的绩效考核和评价运行机制，建设和谐医患关系，监督落实医疗服务和药品价格政策。
贯彻落实国家药物政策和基本药物制度，执行国家基本药物目录，组织遴选阿荣旗基本药物采购目录，制定药品、耗材、医疗器械的采购、配送、结算、使用的监管和实施办法。落实国家基本药物目录和阿荣旗补充药物目录市内生产药品的鼓励扶持政策。
