协调南城县委、南城县政府各部门的职能配置及其调整；协调南城县委各部门之间、南城县政府各部门之间、南城县委各部门与南城县政府各部门之间以及各部门与区县(市)之间的职责分工。
贯彻执行国家和省有关事业单位登记管理的法律、法规、规章，拟定南城县事业单位登记管理的规范性文件，并组织实施；负责市级登记管辖范围内事业单位的登记、年检年审和监督管理工作；负责事业单位登记管理行政复议、行政诉讼应诉工作，检查监督和指导协调南城县事业单位登记管理工作。
负责南城县委、南城县政府各部门的机构设置(含内设机构)、人员编制的审核和科级领导职数的审批，提出南城县委、南城县政府各部门领导班子职数配备的建议；审核区县(市)党政群机关副科级以上机构设置和县乡党政群机关的行政编制总额。
负责南城县机构改革和机构编制管理有关信息的采集和情况综合，负责机构编制统计和培训工作。
