研究拟定巫溪县行政管理体制改革与机构改革方案及有关规定；审核市直各部门和区县(市)党政机构改革方案；指导、协调各级行政管理体制改革和机构改革以及机构编制管理工作。
负责巫溪县人大、市政协、市中级人民法院、市人民检察院机关和各民主党派、人民团体机关的机构设置(含内设机构)、人员编制的审核和科级领导职数的审批，提出领导班子职数配备的建议。
贯彻执行国家和省有关事业单位登记管理的法律、法规、规章，拟定巫溪县事业单位登记管理的规范性文件，并组织实施；负责市级登记管辖范围内事业单位的登记、年检年审和监督管理工作；负责事业单位登记管理行政复议、行政诉讼应诉工作，检查监督和指导协调巫溪县事业单位登记管理工作。
协调巫溪县委、巫溪县政府各部门的职能配置及其调整；协调巫溪县委各部门之间、巫溪县政府各部门之间、巫溪县委各部门与巫溪县政府各部门之间以及各部门与区县(市)之间的职责分工。
