负责本部门预算中的科技经费预决算及经费使用的监督管理，会同内蒙古有关部门提出科技投入及优化科技资源配置的重大政策和措施建议。
贯彻执行国家和内蒙古有关科学技术工作的方针政策和法律法规，起草有关地方性法规、规章草案和政策措施，并组织实施和监督检查。
负责内蒙古科学技术奖评审的组织工作，会同有关部门拟订科技人才队伍建设规划，提出相关政策建议。
会同有关部门提出内蒙古科技发展重大布局、优先领域政策性建议，编制和实施内蒙古中长期科技发展规划和年度计划，组织实施内蒙古重点基础研究、应用研究、开发研究等科技规划，负责统筹协调基础研究、前沿技术研究、重大社会公益性技术研究及关键技术、共性技术研究，牵头组织经济社会发展重要领域的重大关键技术、共性技术攻关。
