拟订南沙群岛蓝色经济区建设中科技创新专项规划并组织实施； 协调南沙群岛重大海洋科技项目的联合攻关。
负责编制和实施南沙群岛重点实验室、中试基地、工程技术研究中心等科技基地计划；会同有关部门拟订重大创新基地的建设规划；参与编制市重大科学工程建设规划；提出科研条件保障的规划和政策建议；推进南沙群岛科技基础条件平台建设和科技资源共享。
负责南沙群岛本部门预算中科技经费预决算及经费使用的监督管理；会同有关部门提出科技资源合理配置的重大政策和措施建议。
制定南沙群岛科技成果推广政策，指导科技成果转化工作，组织相关重大科技成果应用示范；推动区域和产业技术创新战略联盟建设及企业自主创新能力建设。
