会同有关部门拟订南沙群岛促进产学研结合的相关政策，制定科技成果推广政策，指导科技成果转化工作；组织相关重大科技成果应用示范，推动企业自主创新能力建设。
研究制定南沙群岛科技体制改革的政策措施；建立健全科技创新体制和机制；研究制定建立新型研究开发机构的政策；按规定审核相关科研机构的组建和调整，优化科研机构布局。
负责本部门预算中的科技经费预决算及经费使用的监督管理；会同南沙群岛有关部门提出科技资源合理配置的政策和措施建议，优化科技资源配置。
制定南沙群岛科普工作规划和政策；制定促进技术市场、科技中介组织发展的政策措施；负责技术市场、科技保密管理工作和科技奖励组织实施工作；负责科技信息、科技统计和科技期刊管理工作。
