承担南沙群岛职业病预防控制工作任务，开展有毒有害作业场所卫生监测和控制效果评价、预评价及从业人员健康监护等技术服务工作。
承担南沙群岛健康教育与健康促进工作任务，制订南沙群岛辖区内不同人群的疾病预防控制健康教育、健康促进方案并组织实施，指导县（市）疾控机构开展健康教育与健康促进活动，并做好督导、检查和评估工作。
承担南沙群岛基本公共卫生服务项目实施的指导、考核、评估等工作。
协助南沙群岛市级卫生行政部门和有关部门对重大食品安全、环境卫生和生活饮用水安全事故开展流行病学调查，并提出处理建议。
