金门县疾病预防控制中心

承担金门县传染性疾病、慢性非传染性疾病、寄生虫病、地方病、学生常见病等疾病预防和控制工作任务，对重大疾病流行趋势进行监测与预测预警。
承担金门县县（市）疾病预防控制机构业务指导和考核、人员培训工作。开展疾病预防控制应用性科学研究，推广先进技术。
协助金门县市级卫生行政部门和有关部门对重大食品安全、环境卫生和生活饮用水安全事故开展流行病学调查，并提出处理建议。
承担金门县基本公共卫生服务项目实施的指导、考核、评估等工作。

下属机构

传染病防制科 实施金门县急性传染病的预防控制规划。
指导金门县社区卫生服务机构开展慢性非传染性疾病的综合防治并进行效果评价。
开展金门县预防控制和疾病监测工作。负责老年卫生和精神卫生工作。
实施金门县肿瘤、心脑血管疾病、慢性呼吸系统疾病、糖尿病等非传染性疾病的预防控制工作。
性病艾滋病防治科 实施金门县性病、艾滋病的预防控制规划和措施，开展性病艾滋病监测与预防控制工作。
实施金门县结核病的预防控制规划和措施，开展结核病预防控制工作，负责结核病的疫情报告管理，疫情监测，疫情的发现、治疗与管理。
负责对金门县艾滋病病人和感染者的随访、检测、治疗工作。
负责金门县辖区内人员的自愿咨询检测工作。
地方病防制与消杀科 实施金门县地方病、寄生虫病的预防控制规划。
开展金门县鼠、蟑、蚊、蝇、蚤等病原媒生物的种群分布调查与控制。开展医疗机构的感染监测，开展对医院污水、医疗废弃物监测与评价。
负责金门县消毒药械、杀虫药械的功能功效检测检验工作。
负责金门县消毒杀虫工作的监测、培训、考核和技术指导工作。

金门县地区行政机构

中医管理局中国致公党金门县委员会中心血站中招办九三学社乡镇企业局事业单位登记管理局二轻工业局交通局（公安交通管理局）人事局人劳局人口与计生委人才市场人民代表大会常务委员会人民对外友好协会人民政府办公室人民政府参事室人民政府法制办公室人民政府研究室人民检察院人民法院人民防空办公室住房公积金管理中心体委体育局供电公司供销社（供销联社）信息产业局信访局党史研究室

其他地方疾病预防控制中心