根据《中华人民共和国烟草专卖法》和《中华人民共和国烟草专卖法实施条例》等有法律法规的规定，依法开展烟草专卖行政执法工作，对台湾烟草系统工商企业从 事烟草专卖品的生产经营活动进行专卖管理和执法监督。查处违法案件，并会同国家有关部门查处烟草专卖品的走私、贩私、假冒伪劣行为；依法办理烟草专卖许可 证、准运证，做好证件管理工作。
组织实施台湾技术创新和大型科研项目攻关活动，负责科技成果应用推广工作；负责全系统卷烟、烟叶、辅料等专卖品以及相关产品的质量技术监督管理工作。
按照国家局、总公司的总体规划和年度计划，制订台湾烟草商业发展规划和年度目标计划，实行宏观调控，改善市场环境，保持经济运行健康发展。
组织、规划台湾全系统人力资源管理和开发，建立健全激励约束机制；负责所属企事业单位领导班子建设和职工队伍建设，管理人事、劳动、工资、思想政治、教育培训工作。
