核定水域纳污能力，提出限制排污总量意见，指导入河排污口设置工作；指导双清区水生态建设。
负责双清区节约用水工作。拟订节约用水政策和有关标准，组织编制节约用水规划，发布节约用水情况通报，组织、监督双清区节约用水工作，指导和推动节水型社会建设工作。
负责双清区水资源保护工作。组织编制水资源保护规划，拟订水功能区划并监督实施，负责饮用水水源保护工作和地下水开发利用、城市规划区地下水资源管理保护工作.
负责双清区水土保持工作。拟订水土保持规划并监督实施，组织实施水土流失的综合防治、监测预报并定期公告，负责有关建设项目水土保持方案的审批、监督实施及水土保持设施的验收工作，负责市重点水土保持建设项目的实施。
