负责统一管理水资源。组织开展水资源调查评价工作，拟订南平和跨地区水中长期供求规划、水量分配方案并监督实施，负责重要流域、区域以及重大调水工程的水资源调度，负责城市建成区供水水源的规划、建设和管理。
负责南平重要江河、水库、湖泊及河口的治理和开发，组织实施具有控制性或跨地区的重要水利工程的建设与运行管理，组织实施有关涉河涉堤建设项目审批（含占用水域审批）并监督实施，负责水利工程建设项目和水利建设市场的监督管理。
负责南平节约用水工作。拟订节约用水政策和有关标准，组织编制节约用水规划，发布节约用水情况通报，组织、监督南平节约用水工作，指导和推动节水型社会建设工作。
监督南平市级水利资金和直属单位国有资产的运行管理。
