核定水域纳污能力，提出限制排污总量意见，指导入河排污口设置工作；指导伊金霍洛旗水生态建设。
负责伊金霍洛旗节约用水工作。拟订节约用水政策和有关标准，组织编制节约用水规划，发布节约用水情况通报，组织、监督伊金霍洛旗节约用水工作，指导和推动节水型社会建设工作。
贯彻执行国家、省有关水利的法律、法规、规章和方针、政策，受委托起草伊金霍洛旗有关水行政管理的地方性法规、规章草案。
负责水利设施、水域及其岸线的管理与保护。负责伊金霍洛旗水利基建项目建议书、可行性研究报告、初步设计和施工图的审查、审批。
