南通气象局

负责管理南通大型建设工程、重点工程、爆炸和火灾危险环境、人员密集场所等的雷电灾害风险评估。
负责对南通行政区域内气象行政许可项目的审核，发放审核意见书。具体负责组织管理雷电灾害防御工作，会同南通有关部门指导对可能遭受袭击的建筑物、构筑物和其它设施安装的雷电灾害防护装置的检测工作。
组织开展南通各类气象科技技术服务工作。
承担上级气象主管机构和南通人民政府交办的其它事项。

下属机构

防雷中心 负责南通防雷专业人员的技术培训等工作。指导农村防雷工作。
承担南通建设项目雷击风险评估，建设项目防雷装置设计技术评价、跟踪检测、竣工检测，防雷装置的定期检测。
承担南通防雷减灾科普宣传。
承担南通雷击灾情调查、收集和上报。
气象服务中心 承担南通地方政府对气象服务工作的有关任务。
承担南通气象影视制作等媒体气象服务工作。负责气象网站日常维护。
承担南通专业服务产品开发、气象科普宣传、人工影响天气、气象讲座培训、课题研究等相关工作。开展气候资源的分析、评估和研究。开展气象信息咨询服务。
主要负责南通农业、生态、旅游、交通、能源等专业气象服务工作。
气象台 完成南通气象局领导交办的其它工作。
负责南通气象设施维修等工作。依法保护气象探测环境和气象设施等。
负责南通行政区域内气象探测资料的采集、传输，综合自动气象站探测数据质量控制。
承担南通网络、计算机、通讯设备、视频系统等网络设备的管理与安全维护工作。

南通地区行政机构

中医管理局中国致公党南通委员会中心血站中招办九三学社乡镇企业局事业单位登记管理局二轻工业局交通局（公安交通管理局）人事局人劳局人口与计生委人才市场人民代表大会常务委员会人民对外友好协会人民政府办公室人民政府参事室人民政府法制办公室人民政府研究室人民检察院人民法院人民防空办公室住房公积金管理中心体委体育局供电公司供销社（供销联社）信息产业局信访局党史研究室

其他地方气象局