组织、指导自流井区森林资源（含经济林、薪炭林、热带林作物及其他特种用途林）的管理；组织自流井区森林资源调查、动态监测和统计，审核并监督森林资源的使用；组织编制森林采伐限额，报上级批准后监督执行；监督林木、竹木的凭证采伐与运输；组织指导林地、林权管理并对依法应由国家、省、市和县批准的林地征用、占用进行初审。
组织、指导自流井区陆生野生动植物的保护和合理开发利用；在国家和省市县自然保护区的区划、规划原则指导下，指导森林和陆生野生动植物类型自然保护区的建设和管理；组织、协调自流井区湿地保护和有关国际公约的履行工作；负责陆生濒危物种进口管理和国家保护的野生动物、珍稀树种木材、珍稀野生动植物及其产品进出口的审核、申报工作；组织协调有关国际公约的履行工作。
组织协调、指导监督自流井区森林防火工作，发布森林火灾信息，指导管理自流井区森林公安工作；指导、协调、监督查处破坏森林资源和国家重点保护野生动植物资源的重大案件；组织、指导自流井区森林病虫害防治、检疫。
研究提出林业经营的方针政策、实施规划和自流井区林业发展的经济调节意见；监管国有林业资产；预审和申报重点林业建设项目；指导管理自流井区林业基本建设。
