负责互助土族自治县市级教育经费的统筹管理；检查区、县级市教育财政拨款的投入、执行和使用情况；指导学校的基本建设和财务管理工作；指导和监督市教育系统的内部审计工作，对局属单位的经济活动进行审计监督。
指导互助土族自治县学校的思想政治教育工作、德育工作、团队工作、体育卫生与艺术教育、国防教育和宣传工作；组织、指导互助土族自治县普通高等学校、高中阶段学校（含普通高中、中等职业学校、技工学校、职业高中）学生军事训练工作；指导学校的安全、稳定和保卫工作。
赋予互助土族自治县教育局党委负责本系统的党建、统战和干部管理工作职责。
负责互助土族自治县学前教育、基础教育（含特殊教育）、职业教育、成人教育和高等教育事业与发展的统筹管理工作；指导学校开展教育教学改革和办学体制、学校内部管理体制改革；指导学校进行专业建设、课程建设和教材建设；负责推进义务教育均衡发展和促进教育公平；指导互助土族自治县成人文化教育、社区教育、职工教育和农民文化技术教育工作；指导互助土族自治县教育招生考试工作。
