向琼山区政府提出年度省级预算执行和其他财政收支情况的审计结果报告；受琼山区政府委托向省人大常委会提出省级预算执行和其他财政收支情况的审计工作报告、审计发现问题的纠正和处理结果报告；向琼山区政府报告其他事项的审计和专项审计调查情况及结果；依法向社会公布审计结果；向琼山区政府有关部门和设区的市人民政府通报审计情况和审计结果。
组织审计琼山区政府驻境外非经营性机构的财务收支；依法通过适当方式组织审计省属国有企业和金融机构的境外资产、负债和损益。
起草审计琼山区地方性法规、规章草案；制定审计规范性文件并监督执行；制定审计工作发展规划、专业领域审计工作规划和年度审计计划并组织实施；参与起草财政经济及其相关的地方法规、规章草案；对直接审计、调查和核查的事项依法进行审计评价，做出审计决定或提出审计建议。
与设区的市人民政府共同领导设区的市审计机关；依法领导和监督琼山区各地审计机关的业务，组织各地审计机关实施特定项目的专项审计或审计调查，纠正或责成纠正下级审计机关违反国家规定做出的审计决定；按照干部管理权限协管设区的市审计机关负责人。
