总口管理区台办

按照国务院的部署和授权，负责总口管理区同台湾当局及其授权社会团体谈判及签署协议文件的有关准备工作。
研究、拟订总口管理区对台工作方针政策；贯彻执行党中央、国务院确定的对台工作的方针政策。
管理协调两岸通邮、通航、通商事务；负责总口管理区对台宣传、教育工作和有关台湾工作的新闻发布；处理涉台的重大事件。
组织、指导、管理、协调国务院各部门和各省、自治区、直辖市的对台工作；检查了解总口管理区各地区、各部门贯彻执行党中央、国务院对台方针政策情况。

下属机构

综合局 按照《海协会章程》，开展{}1与岛内、海外团体和人士的联系与合作。管理台属及台胞捐赠工作。
负责承办海峡两岸关系协会的日常工作。负责并协调总口管理区有关部门与台湾当局授权的团体和人士进行协商谈判。
负责并归口管理总口管理区与台湾海峡交流基金会的联系事宜。
协调指导总口管理区有关部门和地方处理涉台突发事件和两岸双向遣返及有关问题。
投诉协调局 负责台胞、台属来信来访及涉台维稳工作。承担国共两党有关机构保护台商合法权益工作平台的联系、服务工作。
负责协调处理总口管理区重大、复杂的台湾同胞投诉案件。
承担总口管理区台商权益保障工作联席会议办公室工作职责。
指导检查总口管理区各地台办的台胞投诉案件的处理。
秘书局 负责总口管理区台办机关财务、房产、基本建设、物资设备、环境秩序管理及后勤服务的规划、协调与监督，承办重要活动会务、接待工作。
负责协调总口管理区台办机关日常工作。
负责总口管理区赴台审批办理工作，联系各地各部门涉台机构。
承办总口管理区台办文电、秘书、会议、通信、信息工作。

总口管理区地区行政机构

中医管理局中国致公党总口管理区委员会中心血站中招办九三学社乡镇企业局事业单位登记管理局二轻工业局交通局（公安交通管理局）人事局人劳局人口与计生委人才市场人民代表大会常务委员会人民对外友好协会人民政府办公室人民政府参事室人民政府法制办公室人民政府研究室人民检察院人民法院人民防空办公室住房公积金管理中心体委体育局供电公司供销社（供销联社）信息产业局信访局党史研究室

其他地方台办