海南台办

管理协调两岸通邮、通航、通商事务；负责海南对台宣传、教育工作和有关台湾工作的新闻发布；处理涉台的重大事件。
按照国务院的部署和授权，负责海南同台湾当局及其授权社会团体谈判及签署协议文件的有关准备工作。
研究台湾形势和两岸关系发展动向；协调海南有关部门研究、草拟涉台的法律、法规，统筹协调涉台法律事务。
组织、指导、管理、协调国务院各部门和各省、自治区、直辖市的对台工作；检查了解海南各地区、各部门贯彻执行党中央、国务院对台方针政策情况。

下属机构

综合局 按照《海协会章程》，开展{}1与岛内、海外团体和人士的联系与合作。管理台属及台胞捐赠工作。
协调指导海南有关部门和地方处理涉台突发事件和两岸双向遣返及有关问题。
负责并归口管理海南与台湾海峡交流基金会的联系事宜。
负责承办海峡两岸关系协会的日常工作。负责并协调海南有关部门与台湾当局授权的团体和人士进行协商谈判。
经济局 指导、管理海南台资企业协会，负责对台资企业的政策指导及服务工作。
会同海南有关部门和地方协调对台重要经贸项目和活动。
会同海南有关部门研究、草拟对台经济、贸易、金融、科技等方面的法律、法规、政策，并负责协调和检查落实。
研究协调海南对台商投资和赴台投资的政策。
秘书局 负责海南赴台审批办理工作，联系各地各部门涉台机构。
负责海南台办机关财务、房产、基本建设、物资设备、环境秩序管理及后勤服务的规划、协调与监督，承办重要活动会务、接待工作。
负责海南台办档案、报刊、图书资料工作。编辑刊物。
承办海南台办文电、秘书、会议、通信、信息工作。

海南地区行政机构

专用通信局中国致公党海南委员会乡企局交通运输厅（交通厅）人事厅人力资源和社会保障厅人口和计划生育委员会人防办住房和城乡建设厅体育局供销社保密委员会办公室保监会信访局党史研究室党校公安厅共青团农业厅农牧厅农科院出版局劳动和社会保障厅卫生厅参事室发改委台办司法厅商务厅国土资源厅

其他地方台办