贯彻执行党和国家有关卫生工作的方针、政策和法律、法规、规章；结合卓尼县当地实际，研究起草卫生工作的地方性法规、规章草案和政策；研究制订卓尼县当地卫生事业发展改革的有关方案、工作规划、政策和指导性意见，并组织实施。
负责对卓尼县传染病防治、公共场所卫生、饮水卫生、学校卫生、职业卫生等相关公共卫生实施监督管理。研究监测各类与人群健康密切相关的重大危险、致病因素。
负责制定卓尼县当地中医药工作发展规划，促进中医药事业和中西医结合工作的协调发展。
负责收集、发布卓尼县当地公共卫生、医疗服务等有关卫生信息和政务公开信息；组织开展医学卫生领域的国际交流与合作。
