研究制定会昌县社区卫生、农村卫生、妇幼卫生、初级卫生保健工作规划和政策，并组织实施。
贯彻执行党和国家有关卫生工作的方针、政策和法律、法规、规章；结合会昌县当地实际，研究起草卫生工作的地方性法规、规章草案和政策；研究制订会昌县当地卫生事业发展改革的有关方案、工作规划、政策和指导性意见，并组织实施。
负责制订会昌县当地卫生科技发展规划，组织会昌县当地重大卫生问题研究和重点科研项目攻关，并指导科技成果的转化和推广；负责会昌县当地与人群健康有关的实验室及其实验活动的生物安全监督工作。
根据会昌县当地国民经济和社会发展总体规划，编制会昌县当地卫生事业的发展规划、区域卫生规划和年度工作计划，并负责组织实施。
