扬州卫生局

负责扬州当地突发公共卫生事件和涉及卫生的突发公共事件的应急管理工作；负责建立扬州当地院前急救系统和医疗救治系统，组织开展应急医疗救护工作。
依法管理扬州医疗机构内部临床药事工作。协助价格主管部门制订医疗卫生服务价格，负责监管各级各类医疗卫生机构的医疗服务价格执行情况。
负责制定扬州当地卫生人才发展规划；指导、组织开展卫生专业技术职务聘任和任职资格认证的有关工作；负责制定卫生从业人员继续教育和有关专业培养计划和方案，并组织实施。
承办扬州当地政府交办的其他事项。

下属机构

疾病控制处 组织对扬州重大传染病、地方病的综合防治、监测和疫情报告，对重大突发疫情实施紧急处置。
组织指导扬州免疫规划的实施和疫苗接种异常反应事件的调查处置。
指导重大疾病防控体系建设。
拟订扬州健康促进工作规划和计划并组织实施。
法制监督处 承担扬州卫生局行政规范性文件的合法性审核和有关备案工作。
承担扬州卫生局行政复议和应诉的有关工作。
起草卫生方面的扬州地方性法规草案、政府规章草案。
组织开展整顿和规范扬州医疗服务市场工作，组织打击非法行医，督查督办重大违法案件。
卫生应急办公室 组织协调扬州重大自然灾害、恐怖事件、中毒事件及核辐射事故等的紧急医疗救援工作。
建立、完善扬州卫生应急信息系统。
指导扬州突发公共卫生事件的预防准备、监测预警、处置救援、风险分析评估等卫生应急工作。
承担扬州突发公共卫生事件应急指挥部办公室工作。

扬州地区行政机构

中医管理局中国致公党扬州委员会中心血站中招办九三学社乡镇企业局事业单位登记管理局二轻工业局交通局（公安交通管理局）人事局人劳局人口与计生委人才市场人民代表大会常务委员会人民对外友好协会人民政府办公室人民政府参事室人民政府法制办公室人民政府研究室人民检察院人民法院人民防空办公室住房公积金管理中心体委体育局供电公司供销社（供销联社）信息产业局信访局党史研究室

其他地方卫生局