负责实施耿马县出入境卫生检疫、传染病监测和卫生监督。负责口岸传染病的预防与控制工作，负责出入境人员的预防接种和传染病监测体检管理工作。
负责实施耿马县出入境交通运载工具和集装箱及容器的卫生监督、检疫监督和有关的适载检验、鉴定，负责出入境交通运载工具、集装箱、包装物及铺垫材料和货物的卫生除害处理的管理工作。
负责耿马县出入境检验检疫科技、标准化和信息化工作，负责有关的国际合作与交流工作。
贯彻执行耿马县出入境卫生检疫、动植物检疫和进出口商品检验法律、法规和政策规定的实施细则、办法及工作规程，负责耿马县所辖区域的出入境检验检疫、鉴定、认证和监督管理行政执法工作。
