负责实施理县对进出口食品、动植物及其产品等的生产(养殖、种植)、加工和存放等单位的卫生、检疫注册，负责实施进口安全质量许可和出口质量许可工作，负责实施进出口产品、体系认证和实验室认可、人员注册等工作，并监督管理。
负责人事管理、教育培训、外事、财务、基建、物资管理、纪检监察、精神文明建设与思想政治工作。
负责实施理县进出口商品(含食品)的法定检验和监督管理，负责实施一般包装和出口危险品货物包装检验，负责进出口商品鉴定管理工作，负责实施外商投资财产鉴定。办理进出口商品复验工作。
负责理县出入境检验检疫科技、标准化和信息化工作，负责有关的国际合作与交流工作。
