指导互助土族自治县农业生产。组织落实促进主要农产品生产发展的相关政策措施，指导农业标准化、规模化生产，引导农业产业结构调整和农产品品质改善；提出互助土族自治县农业固定资产投资规模和方向、县级发展农业的财政性资金安排建议；配合有关部门组织实施农业综合开发和基本农田建设项目。
承担互助土族自治县农业防灾减灾工作。监测、发布农业灾情；组织开展种子、化肥等救灾物资储备和调拨工作；提出农业生产救灾资金安排建议；指导农业紧急救灾和灾后恢复生产。
负责互助土族自治县农业生态和农村能源有关工作。制定并实施农业生态建设规划；指导农村可再生能源综合开发与利用、农业生物质产业发展、农业农村节能减排、农业面源污染治理；提出划定农产品禁止生产区域的意见、建议和报批工作，指导生态农业、循环农业发展；负责保护渔业水域生态环境，牵头管理外来物种。
指导互助土族自治县农业产业化发展。促进农业产前、产中、产后一体化发展。拟订并组织实施农产品加工业发展规划，提出农业产业保护政策建议，培育、保护和发展农产品品牌；指导互助土族自治县农产品加工业结构调整、技术创新和服务体系建设；制定农业生产资料、主要农产品市场体系建设发展规划。
