依法开展苍南县有关农业生产资料行政许可的初审及监督管理。实施农作物种子（种苗）、草种、种畜禽、农药、兽药、饲料、饲料添加剂的许可及初审、报批及监督管理；负责渔政渔港监督管理和渔船检测检验管理工作；组织实施苍南县有关农业生产资料的地方标准；开展兽医医疗器械和有关肥料的监督管理；指导农业机械化发展、农机安全监理和机动渔业船舶操作手培训工作。
负责苍南县农业资源区划和资源保护工作。拟订农用地、耕地、基本农田质量保护与改良措施并指导实施，依法管理耕地质量；运用工程、农艺、农机、生物等措施，发展资源节约型、环境友好型农业。
负责苍南县农业和农村工作的组织领导及综合协调。贯彻执行党和国家有关农业农村经济工作的方针政策、法律法规，拟订并组织实施苍南县种植业、畜牧业、渔业、农业机械化、农产品加工等农业产业和农村经济发展规划，提出农村改革发展建议；承担农村经济与社会发展预测及综合统计工作。
负责苍南县农作物重大病虫害及动物重大疫病防控。指导动植物防疫和检疫体系建设；组织、监督苍南县动植物防疫检疫工作，发布疫情并组织扑灭；组织植物检疫性有害生物普查；承担引进农作物种子（种苗）检疫工作；负责兽医医改、兽药药政监督管理、牲畜定点屠宰监督管理工作。
