承担吉木萨尔县农产品质量安全监督管理责任。开展农产品安全风险评估，组织农产品质量安全监测，发布有关农产品质量安全信息；拟订有关农产品质量安全的地方标准，并会同有关部门组织实施；指导农业检验检测体系建设；依法实施符合安全标准的农产品产地认定和产品认证；组织农产品质量安全的监督管理。
协调吉木萨尔县农业各产业和农村经济发展；指导农村二、三产业发展，扶持发展农产品加工流通业、乡村旅游等服务业。
依法开展吉木萨尔县有关农业生产资料行政许可的初审及监督管理。实施农作物种子（种苗）、草种、种畜禽、农药、兽药、饲料、饲料添加剂的许可及初审、报批及监督管理；负责渔政渔港监督管理和渔船检测检验管理工作；组织实施吉木萨尔县有关农业生产资料的地方标准；开展兽医医疗器械和有关肥料的监督管理；指导农业机械化发展、农机安全监理和机动渔业船舶操作手培训工作。
组织和指导吉木萨尔县社会主义新农村建设。提出农村社会事业发展政策建议，并协调相关事项；组织开展吉木萨尔县新农村建设试点工作；参与农村社会发展、基层组织建设、精神文明建设和民主法制建设相关工作。
