承担完善四川农村经营管理体制工作。研究提出深化农村经济体制改革和稳定完善农村基本经营制度的政策建议，指导农村土地承包、耕地经营权流转、承包纠纷仲裁和农村集体资产管理，指导、监督减轻农民负担和村民筹资筹劳管理工作。
负责四川农产品质量安全监督管理。负责农产品质量安全监测，指导农业检验检测体系建设，完善农产品质量管理体系，负责食用农产品（水产品除外）从种植养殖环节到进入批发、零售市场或生产加工企业前的质量安全监督管理。
组织四川重大植物检疫性有害生物监测、普查与防控，依法负责境外引进农作物种子（种苗）检疫审批监管、向国外申请农业植物新品种有关工作。组织兽医医政、兽药药政药检和畜禽屠宰管理工作，负责执业兽医资格认证及管理。
负责组织四川农业资源区划工作，指导农用地、宜农滩涂、宜农湿地、牧草地和农业生物物种资源的保护和管理，负责主管的野生植物保护工作。
