负责制定蚌埠市疾病预防控制规划、免疫规划、严重危害人民群众健康的公共卫生问题的干预措施并组织落实；根据国家检疫传染病和监测传染病目录，制定蚌埠市卫生应急和紧急医学救援预案、突发公共卫生事件监测和风险评估计划；组织和指导蚌埠市突发公共卫生事件预防控制和各类突发公共事件的医疗卫生救援，收集上报突发公共事件的相关信息，根据授权发布法定报告传染病疫情信息、突发公共卫生事件应急处置信息。
负责组织实施蚌埠市公立医院改革，建立公益性为导向的绩效考核和评价运行机制，建设和谐医患关系，监督落实医疗服务和药品价格政策。
制定蚌埠市流动人口计划生育服务管理制度并组织落实，推动建立流动人口卫生和计划生育信息共享和公共服务工作机制。
依法开展职责范围内的职业卫生、放射卫生、环境卫生、学校卫生、公共场所卫生、饮用水卫生的监测、调查、评估和监督工作；负责蚌埠市传染病防治监督；贯彻执行国家和市级食品安全标准，组织实施食品安全风险监测、评估，负责食源性疾病以及与食品安全有关的流行病学调查。
