新竹县疾病预防控制中心

承担新竹县重大突发公共卫生事件调查与处置工作任务。
承担新竹县基本公共卫生服务项目实施的指导、考核、评估等工作。
承担新竹县病原微生物、毒物、污染物等检验及相关鉴定工作；承担新竹县辖区内疾病预防控制机构实验室质量控制工作。
协助新竹县市级卫生行政部门和有关部门对重大食品安全、环境卫生和生活饮用水安全事故开展流行病学调查，并提出处理建议。

下属机构

地方病防制与消杀科 开展对新竹县地方病和寄生虫病的诊疗服务。研究消杀工作常规、措施和技术标准。
负责新竹县消毒杀虫工作的监测、培训、考核和技术指导工作。
负责新竹县消毒药械、杀虫药械的功能功效检测检验工作。
开展新竹县鼠、蟑、蚊、蝇、蚤等病原媒生物的种群分布调查与控制。开展医疗机构的感染监测，开展对医院污水、医疗废弃物监测与评价。
性病艾滋病防治科 负责对新竹县高危场所的高危人群的干预工作。
负责新竹县辖区内人员的自愿咨询检测工作。
负责对新竹县艾滋病病人和感染者的随访、检测、治疗工作。
实施新竹县结核病的预防控制规划和措施，开展结核病预防控制工作，负责结核病的疫情报告管理，疫情监测，疫情的发现、治疗与管理。
传染病防制科 参与新竹县卫生突发事件、不明原因疾病的调查，对急性传染病爆发等重大疫情、重大灾害进行紧急处置和控制。
实施新竹县肿瘤、心脑血管疾病、慢性呼吸系统疾病、糖尿病等非传染性疾病的预防控制工作。
开展新竹县预防控制和疾病监测工作。负责老年卫生和精神卫生工作。
指导新竹县社区卫生服务机构开展慢性非传染性疾病的综合防治并进行效果评价。

新竹县地区行政机构

中医管理局中国致公党新竹县委员会中心血站中招办九三学社乡镇企业局事业单位登记管理局二轻工业局交通局（公安交通管理局）人事局人劳局人口与计生委人才市场人民代表大会常务委员会人民对外友好协会人民政府办公室人民政府参事室人民政府法制办公室人民政府研究室人民检察院人民法院人民防空办公室住房公积金管理中心体委体育局供电公司供销社（供销联社）信息产业局信访局党史研究室

其他地方疾病预防控制中心