负责额济纳旗水文资料的收集、汇总、审定、裁决，为政府防灾减灾提供有关水文水资源方面的技术支持。为涉水工程立项、水事纠纷、水行政案件裁决提供有关水文资料的审查意见。
协同有关部门编制额济纳旗水土保持生态环境监测站网的规划、建设和管理。具体承担额济纳旗水土保持生态环境信息的监测、分析评价和年报编制。
负责额济纳旗境内从事水文勘测、水文情报预报、水文分析计算与水资源调查评价的资格认证工作。
受厅委托进行额济纳旗水资源综合规划和有关专业规划编制、水功能区划分、江河湖库纳污能力审定、提出限制额济纳旗排污总量的意见等具体业务技术工作。
