玉屏县水利局

核定水域纳污能力，提出限制排污总量意见，指导入河排污口设置工作；指导玉屏县水生态建设。
组织、指导玉屏县水政监察和水行政执法。负责重大涉水违法事件的查处，协调、指导水事纠纷的处理。
负责玉屏县水资源保护工作。组织编制水资源保护规划，拟订水功能区划并监督实施，负责饮用水水源保护工作和地下水开发利用、城市规划区地下水资源管理保护工作.
负责玉屏县节约用水工作。拟订节约用水政策和有关标准，组织编制节约用水规划，发布节约用水情况通报，组织、监督玉屏县节约用水工作，指导和推动节水型社会建设工作。

下属机构

科技与水产处 承担渔事纠纷处理工作。负责玉屏县渔船、渔机、网具监督管理。
对玉屏县水产品产地质量安全标准执行情况进行监督检查。
组织玉屏县水生动植物病害防控、水生动物防疫检验、渔业水域生态环境及水生野生动植物保护工作。
保护和合理开发利用玉屏县渔业资源。指导渔业标准化生产和健康养殖。
水政水资源科 审查玉屏县入河排污口设置，负责计划用水和节约用水工作。
指导玉屏县水量分配、水功能区划和水资源调度工作并监督实施，指导饮用水水源保护、城市供水水源规划及非传统水资源开发利用工作、
组织实施玉屏县水资源取水许可、有偿使用、水资源论证等制度，组织水资源调查、评价和监测工作.
负责玉屏县水利法制工作，承担水事纠纷协调处理工作，承办机关行政诉讼、行政复议和行政赔偿工作。
工程管理科 组织编制玉屏县水库运行调度规程及大坝、水闸等水利工程运行管理与确权划界工作。
负责玉屏县河道、水库岁修及险工治理计划编制上报、建设管理工作。
指导玉屏县水库、大坝等水工程安全监管。
负责玉屏县水利工程设施、水域及其岸线管护工作。

玉屏县地区行政机构

中医管理局中国致公党玉屏县委员会中心血站中招办九三学社乡镇企业局事业单位登记管理局二轻工业局交通局（公安交通管理局）人事局人劳局人口与计生委人才市场人民代表大会常务委员会人民对外友好协会人民政府办公室人民政府参事室人民政府法制办公室人民政府研究室人民检察院人民法院人民防空办公室住房公积金管理中心体委体育局供电公司供销社（供销联社）信息产业局信访局党史研究室

其他地方水利局