核定水域纳污能力，提出限制排污总量意见，指导入河排污口设置工作；指导新余水生态建设。
指导新余水文工作。负责水文水资源监测、水文站网建设和管理，对江河湖库和地下水的水量、水质实施监测，发布水文水资源信息、情报预报。
负责新余水资源保护工作。组织编制水资源保护规划，拟订水功能区划并监督实施，负责饮用水水源保护工作和地下水开发利用、城市规划区地下水资源管理保护工作.
指导新余农村水利工作。组织协调农田水利基本建设，组织、指导农村饮水安全、节水灌溉等工程建设和管理工作，指导农村水利社会化服务体系建设；在职责范围内负责水能资源开发、利用、管理。
