组织实施厦门取水许可、水资源有偿使用制度，组织有关国民经济总体规划和有关专项规划及重大建设项目的水资源论证和防洪论证工作；组织编制并发布厦门水资源公报；指导水利行业供水和农村供水工作。
负责厦门水旱灾害防治工作。组织、协调、监督、指导厦门防汛抗旱工作，组织编制市防汛抗旱应急预案并组织实施，对重要江河湖泊和重要水工程实施防汛抗旱调度和应急水量调度
指导厦门水文工作。负责水文水资源监测、水文站网建设和管理，对江河湖库和地下水的水量、水质实施监测，发布水文水资源信息、情报预报。
负责厦门水资源保护工作。组织编制水资源保护规划，拟订水功能区划并监督实施，负责饮用水水源保护工作和地下水开发利用、城市规划区地下水资源管理保护工作.
