负责提出防城港水利固定资产投资规模和方向、市级财政性资金安排的意见；提出防城港市级水利建设投资建议并组织实施。
负责防城港重要江河、水库、湖泊及河口的治理和开发，组织实施具有控制性或跨地区的重要水利工程的建设与运行管理，组织实施有关涉河涉堤建设项目审批（含占用水域审批）并监督实施，负责水利工程建设项目和水利建设市场的监督管理。
组织、指导防城港水政监察和水行政执法。负责重大涉水违法事件的查处，协调、指导水事纠纷的处理。
负责统一管理水资源。组织开展水资源调查评价工作，拟订防城港和跨地区水中长期供求规划、水量分配方案并监督实施，负责重要流域、区域以及重大调水工程的水资源调度，负责城市建成区供水水源的规划、建设和管理。
