负责管理吉林水文工作。负责水文水资源监测、吉林水文站网建设和管理，对江河湖泊和地下水的水量、水质实施监测，发布水文水资源信息、情报预报和吉林水资源公报。
贯彻执行国家和省有关水行政管理工作的方针政策和法律法规，组织起草吉林有关地方性法规、规章草案。
组织、指导吉林水利设施、江河水域及其岸线的管理与保护，组织、指导大江、大河、河口和滩涂的综合治理与开发，指导水利工程建设与运行管理，组织实施具有控制性的或跨地级以上市及跨流域的重要水利工程建设与运行管理，承担水利工程移民管理工作。
负责保障吉林水资源的合理开发利用，拟订水利战略规划和政策，组织编制吉林重要江河湖泊的流域综合规划和防洪规划，会同吉林有关部门提出水利固定资产投资的规模、方向和省级财政性资金安排的建议，提出省级水利建设投资安排建议并组织实施，按规定权限审批有关水利项目初步设计。
