屏东县水产局

协调屏东县水产局各科站的工作并负责催办查办。
草拟屏东县水产局年度工作安排意见，提报局党委和局长办公会审查并协调组织实施。
负责屏东县水产局行政事务、车辆管理使用。
进行调查研究，综合分析工作情况，提出指导工作的意见和建议。

下属机构

产业发展处 负责屏东县水产大县、水产板块和精养鱼池改造等重大项目管理，会同计财处安排项目资金工作。
研究提出屏东县水产行业产业发展规划。指导屏东县渔业生产、加工、流通和结构调整。
负责屏东县水产健康养殖生产管理，组织推荐、协助验收部级水产健康养殖示范场以及实施省级水产健康养殖示范场的组织申报、验收和考核工作。
负责屏东县水生动植物检疫工作。负责屏东县水产品市场体系建设规划。
渔政处 负责屏东县珍稀濒危水生野生动物的保护管理与开发利用工作。
组织、协调、指导屏东县涉水工程对渔业资源影响的环境评价和资源补偿工作。
负责贯彻国家和屏东县有关渔业法律、法规，负责制定、修订地方性渔业法律法规，并组织实施。
组织、指导和监督屏东县自然保护区和水产种质资源保护区建设与管理工作。
船检港监管理处 负责监督检查屏东县有关规费的征收、管理和使用情况。
负责宣传和贯彻执行国家有关渔港监督、渔船检验管理、水上交通安全管理和渔港水域环境保护方面的方针、政策和法规。
负责组织开展屏东县渔业互助保险、渔业机动渔船燃油补贴管理、渔港规划建设和经营管理，渔业捕捞许可工作。
负责制定屏东县地方性规章制度和管理办法，依法进行渔业船舶登记、渔业水域防污管理和渔港内的安全及港务管理工作，组织检查渔船安全状况并处理渔业水域交通事故。

屏东县地区行政机构

中医管理局中国致公党屏东县委员会中心血站中招办九三学社乡镇企业局事业单位登记管理局二轻工业局交通局（公安交通管理局）人事局人劳局人口与计生委人才市场人民代表大会常务委员会人民对外友好协会人民政府办公室人民政府参事室人民政府法制办公室人民政府研究室人民检察院人民法院人民防空办公室住房公积金管理中心体委体育局供电公司供销社（供销联社）信息产业局信访局党史研究室

其他地方水产局