深圳市政府口岸办公室

制定深圳市口岸工作政策，起草有关地方性法规、规章草案并组织实施。
督促检查口岸检查检验单位按照各自的职责对出入境人员、交通运输工具、货物、行李物品进行查验和管理工作。
承办深圳市委、深圳市政府和深圳市政府办公厅交办的其他工作。
拟订口岸开放规划和计划；负责深圳市政府口岸办公室口岸和具有口岸功能区域开放或关闭的审核申报工作；

下属机构

综合管理服务中心 承担深圳市口岸国有资产管理方面的事务性工作。
负责深圳市政府口岸办公室深圳市口岸“大通关”的日常协调督查工作。
承担深圳市政府口岸办机关的后勤服务工作和电子政务建设方面的技术保障工作。
负责深圳市政府口岸办公室通关统计、分析和作业运行的监督管理。
航空港处 负责深圳市政府口岸办公室航空口岸的综合协调管理及“大通关”工作。
会同有关部门做好空港口岸的建设规划及联检配套设施建设工作；
组织做好空港口岸重大外事接待工作；
参与航空口岸的规划建设及重大活动的协调工作。
陆港管理处 参与口岸区域经济发展规划的研究与制定。
平衡陆港口岸外贸运输计划，做好陆港口岸集疏运工作；
负责深圳市政府口岸办公室陆港口岸及海关特殊监管区的共建文明工作；
协调陆路口岸与所在区深圳市政府、有关部门的关系以及口岸有关单位之间的关系。

深圳市地区行政机构

中医管理局中国致公党深圳市委员会中心血站中招办九三学社乡镇企业局事业单位登记管理局二轻工业局交通局（公安交通管理局）人事局人劳局人口与计生委人才市场人民代表大会常务委员会人民对外友好协会人民政府办公室人民政府参事室人民政府法制办公室人民政府研究室人民检察院人民法院人民防空办公室住房公积金管理中心体委体育局供电公司供销社（供销联社）信息产业局信访局党史研究室

其他地方政府口岸办公室