负责制定沙依巴克区传染病和慢性非传染性疾病的防治规划。依法监测传染病，建立预警机制，防止和控制疫情的暴发和蔓延；组织开展全民健康教育与促进。
负责制定沙依巴克区当地卫生人才发展规划；指导、组织开展卫生专业技术职务聘任和任职资格认证的有关工作；负责制定卫生从业人员继续教育和有关专业培养计划和方案，并组织实施。
根据沙依巴克区当地国民经济和社会发展总体规划，编制沙依巴克区当地卫生事业的发展规划、区域卫生规划和年度工作计划，并负责组织实施。
负责制订沙依巴克区当地卫生科技发展规划，组织沙依巴克区当地重大卫生问题研究和重点科研项目攻关，并指导科技成果的转化和推广；负责沙依巴克区当地与人群健康有关的实验室及其实验活动的生物安全监督工作。
