阜康市卫生局

负责制定阜康市传染病和慢性非传染性疾病的防治规划。依法监测传染病，建立预警机制，防止和控制疫情的暴发和蔓延；组织开展全民健康教育与促进。
负责制定阜康市当地中医药工作发展规划，促进中医药事业和中西医结合工作的协调发展。
负责阜康市有关行政复议受理和行政诉讼应诉工作。
负责阜康市当地突发公共卫生事件和涉及卫生的突发公共事件的应急管理工作；负责建立阜康市当地院前急救系统和医疗救治系统，组织开展应急医疗救护工作。

下属机构

法制监督处 承担阜康市卫生局行政复议和应诉的有关工作。
承担阜康市卫生局行政规范性文件的合法性审核和有关备案工作。
组织开展阜康市消费环节食品安全监督管理和卫生执法监督工作。
组织开展整顿和规范阜康市医疗服务市场工作，组织打击非法行医，督查督办重大违法案件。
疾病控制处 组织指导阜康市免疫规划的实施和疫苗接种异常反应事件的调查处置。
组织对阜康市重大传染病、地方病的综合防治、监测和疫情报告，对重大突发疫情实施紧急处置。
拟订阜康市公共卫生问题的干预措施并组织实施。
拟订阜康市健康促进工作规划和计划并组织实施。
医政处 负责阜康市执行医疗技术应用准入制度和从业人员资格认定及注册工作。
拟订阜康市医疗、护理的技术质量和服务质量以及医疗机构管理的有关政策、规范和标准，并组织实施。
拟订阜康市血液安全管理规范并组织实施，推动无偿献血工作。
指导阜康市医院感染控制体系、医疗急救体系建设。

阜康市地区行政机构

中医管理局中国致公党阜康市委员会中心血站中招办九三学社乡镇企业局事业单位登记管理局二轻工业局交通局（公安交通管理局）人事局人劳局人口与计生委人才市场人民代表大会常务委员会人民对外友好协会人民政府办公室人民政府参事室人民政府法制办公室人民政府研究室人民检察院人民法院人民防空办公室住房公积金管理中心体委体育局供电公司供销社（供销联社）信息产业局信访局党史研究室

其他地方卫生局